札幌校区

札幌校区位于札幌市中心的北大主校区，占地约为177万平方公尺，除位于函馆的水产学部外的所有学部，研究所和研究中心都设在这里。仅仅学生食堂就有10处以上，相当于一条小街的规模。校园的主要大道为一条长1500公尺的南北向大道。各个学部分布在其左右。校园的东侧紧靠着札幌火车站，也靠近札幌地铁的12条站和18条站。随着札幌市的扩展，北大也渐渐成为市中心交通阻塞的影响因素。 北大校园内最著名的景观就是白杨林大道，位于理学部与工学部之间靠近农场附近，长约300米。2004年9月的台风袭击中，具有上百年树龄的白杨树遭到了很大的破坏。1999年起，校园中部的旧理学馆大楼改建为北海道大学综合博物馆。位于校园北区的重要文化遗产札幌农学校第二农场，是根据克拉克博士的构想而建立的模范家畜,中央草坪附近立有克拉克博士的胸像，是来北大参观的游客经常留影的地方。主校园的南面由北海道大学植物园，与主校区相距几千公尺，是札幌市中心最大的绿化地带。

函馆校区

函馆校区位于函馆市区。由水产学部和水产科学研究所组成。前身为札幌农学校水产学科，1935年改名为函馆高等水产学校独立于北大，1949年随着新制大学制度的施行，并入北海道大学，与农学部水产学科合并为水产学部。

五、北海道大学院系专业

文学院 ：哲学文化学 历史学人类学 语言文学 人类系统科学 日本文化论

教育学院 ：教育心理学 教学社会科学 教育基础论 健康体育学

法学院：公法 刑法社会法 民事法 基础法学 政治学

经济学院：经济学 经营学

理学院：数学 物理学科 化学科 生物体科学科 地球行星科学科

医学院：医学科 保健学科

口腔学院：口腔学

药学院：药科学 药学

工学院： 应用理工系学科 信息电子学科 机械智能工学科 环境社会工学科

农学院： 生物资源科学 应用生命科学 生物机能化学 森林科学 畜产科学 农业工学 农业经济学

兽医学院：兽医学

水产学院：海洋生物科学 海洋资源科学 增殖生命科学 资源机能化学